Analisis Whole Genome Sequencing Dan Evaluasi Keamanan Lactobacillus Fermentum Lbr3 Hasil Isolasi Dari Pangan Fermentasi Lemea Sebagai Kandidat Probiotik

Kurnia, Muhammad Hadi and Prof. Agustin Krisna Wardani, STP. M.Si., PhD. (2025) Analisis Whole Genome Sequencing Dan Evaluasi Keamanan Lactobacillus Fermentum Lbr3 Hasil Isolasi Dari Pangan Fermentasi Lemea Sebagai Kandidat Probiotik. Sarjana thesis, Universitas Brawijaya.

Abstract

Penelitian ini mengkaji potensi isolat Lactobacillus fermentum LBR3 yang diperoleh dari makanan fermentasi tradisional Indonesia, lemea, sebagai kandidat probiotik. Dengan memanfaatkan data whole genome sequencing (WGS) yang diproses oleh PT. Genetika Science, penelitian ini melakukan analisis bioinformatika mendalam guna mengidentifikasi profil genetik LBR3. Analisis dilakukan dengan meneliti anotasi genom untuk memprediksi struktur dan fungsi protein serta mengidentifikasi gen-gen yang berkaitan dengan resistensi antibiotik, faktor virulensi, produksi toksin, dan sistem pertahanan seperti CRISPR, prophage, serta insertion sequence. Hasil penelitian ini menunjukkan bahwa Lactobacillus fermentum LBR3 dapat menjadi kandidat probiotik ditinjau dari uji kelayakan dan keamanan yang telah dilakukan. Evaluasi mendalam aspek efektivitas dan keamanan LBR3 ini juga berpotensi meningkatkan nilai tambah lemea sebagai produk lokal, sekaligus menjadi dasar pengembangan produk probiotik yang aman, efektif, dan alternatif terapi probiotik alami untuk mendukung kesehatan pencernaan.

English Abstract

This study examines the potential of the Lactobacillus fermentum LBR3 isolate, obtained from the traditional Indonesian fermented food lemea, as a probiotic candidate. Utilizing whole genome sequencing (WGS) data processed by PT. Genetika Science, the research conducts an in-depth bioinformatics analysis to identify the genetic profile of LBR3. The analysis involved examining genome annotations to predict protein structures and functions, as well as identifying genes related to antibiotic resistance, virulence factors, toxin production, and defense systems such as CRISPR, prophage, and insertion sequences. The results of this study indicate that Lactobacillus fermentum LBR3 may serve as a promising probiotic candidate based on the feasibility and safety tests conducted. This comprehensive evaluation of LBR3’s effectiveness and safety also has the potential to enhance the value of lemea as a local product, providing a foundation for developing safe and effective probiotic products and natural alternative probiotic therapies to support digestive health.

Text (DALAM MASA EMBARGO) Muhammad Hadi Kurnia.pdf Restricted to Registered users only Download (2MB)

Actions (login required)

View Item