IDENTIFIKASI MORFOLOGI DAN MOLEKULER DNA BARCODING PADA BIVALVIA DI KAWASAN MANGROVE DESA TAPAK TUGU KOTA SEMARANG, JAWA TENGAH (24dsa240)

YUSTINA, NURUL (2024) IDENTIFIKASI MORFOLOGI DAN MOLEKULER DNA BARCODING PADA BIVALVIA DI KAWASAN MANGROVE DESA TAPAK TUGU KOTA SEMARANG, JAWA TENGAH (24dsa240). Undergraduate thesis, Fakultas Perikanan dan Ilmu Kelautan.

Abstract

Ekosistem mangrove berada pada wilayah intertidal yang memiliki interaksi
antara perairan laut, payau, sungai dan terestrial. Ekologis ekosistem mangrove
berfungsi sebagai mencegah erosi, feeding ground, nursery ground, dan spawning
ground. Biota yang beragam termasuk spesies bivalvia banyak ditemukan di
ekosistem mangrove sehingga perlu adanya identifikasi spesies untuk
menggambarkan karakteristik spesies. Tujuan penelitian ini adalah mengetahui
spesies bivalvia di lokasi penelitian dan mengetahui hubungan filogenetik. Metode
yang digunakan dalam penelitian adalah deskriptif kuantitatif. Penelitian ini
dilakukan pada bulan September – Desember 2023. Tahapan Identifikasi dikakukan
secara morfologi dan molekuler dengan teknik DNA Barcoding :ekstraksi DNA
(Chelex 10% dan Kit Extraction Zymo Research), amplifikasi, visualisasi, dan
sequencing DNA. Hasil identifikasi spesies bivalvia di menggunakan analisis
morfologi secara berurutan dari BM3, BM4, BM5 dan BM6 adalah Anamolocardia
sp., Geloina sp., BM5 Glycymeris sp., Tivela sp sedangkan sampel yang dapat
dilanjut uji molekuler yaitu BM1 dan BM2 dari hasil morfologi dan molekuler
genetik dengan DNA barcoding menunjukkan hasil Percent Ident secara berurut
BM1 dan BM2 adalah 99,00% untuk D. incarnatus dan untuk P. viridis 99,85%.
Konstruksi pohon filogenetik dengan maximum likelihood pada MEGA XI,
diperoleh hasil bootstrap 94% kode BM1 berkerabat dengan Donax incarnatus
sedangkan nilai bootstrap 100% kode BM2 berkerabat dengan spesies Perna
viridis.

Actions (login required)

View Item